Le patient fait l'objet d'un dépistage des déficits de coagulation et reçoit des antibiotiques par voie intraveineuse pendant la période périopératoire. La sphinctérotomie endoscopique est réalisée après que la CPRE a délimité la partie proximale de l'arbre biliaire à l'aide d'une cholangiographie.
Dans la voie biliaire commune, le sphinctérotome est placé avec plus de précision par l'injection d'un produit de contraste sous visualisation fluoroscopique. Idéalement, environ 5 à 8 mm de fil doivent toucher le toit de l'ampoule.
Le courant mixte est ensuite appliqué. La taille de la coupe finale doit être directement liée à la taille du calcul dans le canal, mais elle ne doit pas dépasser 1 cm. On y parvient en effectuant plusieurs coupes consécutives.
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