Au début de la cholécystectomie laparoscopique, des pinces de préhension passées dans les canules de 5 mm sont utilisées pour rétracter le fond de la vésicule biliaire vers l'épaule droite et pour saisir la poche de Hartmann. L'artère et le canal cystique sont exposés et nettoyés à l'aide d'un dissecteur tel qu'un crochet diathermique passé dans le trocart épigastrique de 10 mm.
L'anatomie de la région ou la présence présumée d'un calcul canalaire peut être confirmée à ce stade par une cholangiographie. Le canal cystique est ouvert et un cathéter spécialisé est introduit. Un produit de contraste est introduit et un amplificateur de brillance est utilisé pour la visualisation. L'échographie laparoscopique est une alternative sensible et spécifique.
Le canal cystique est ensuite ligaturé à l'aide de clips métalliques ou plastiques, puis divisé à l'aide de ciseaux. Cette opération est suivie d'une procédure équivalente pour l'artère cystique : certains préfèrent diathermer les branches de l'artère plutôt que de ligaturer le tronc principal. La vésicule biliaire est ensuite disséquée de la fosse hépatique à l'aide de la diathermie. Cela nécessite une rétraction de son col vers le haut. Après avoir vérifié qu'il n'y a pas de fuites résiduelles de sang ou de bile, la vésicule biliaire est détachée et retirée de l'abdomen. Il faut pour cela transférer le laparoscope de la porte d'entrée infra-ombilicale à la porte d'entrée épigastrique. La vésicule biliaire est alors retirée par la première, la seconde servant de canal d'observation. L'ablation peut être facilitée par l'aspiration du contenu de la viscère encore intrabdominale ou par l'écrasement des calculs à l'aide de pinces ou d'outils spécifiques.
Le défect ombilical est ensuite refermé, l'abdomen irrigué et réinspecté à la recherche de fuites. Enfin, les autres trocarts sont retirés, l'évacuation des gaz est autorisée et tous les points d'entrée abdominaux sont suturés.
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