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Si le carcinome anal est découvert suffisamment tôt, l'excision chirurgicale peut être entreprise sans endommager les muscles du sphincter anal.
Les lésions du canal anal et les lésions plus étendues de l'anus peuvent nécessiter le sacrifice des sphincters par une résection abdominopérinéale du rectum et de l'anus, suivie d'une colostomie permanente dans la fosse iliaque gauche.
La radiothérapie peut être utilisée dans le traitement des carcinomes anaux localisés, tout en préservant la fonction du sphincter anal. Le traitement se fait à l'aide d'aiguilles de radiocésium implantées dans le tissu tumoral. Une colostomie préliminaire peut être nécessaire pour éloigner le contenu de l'intestin de la zone de traitement.
La radiothérapie peut également être utilisée dans le traitement palliatif du carcinome anal.
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