Un dépistage de la septicémie est effectué chez les nouveau-nés dans toutes les circonstances où une septicémie est envisagée. Il est important de pouvoir justifier la non-réalisation d'une partie du dépistage ; un dépistage incomplet est rarement indiqué. Dans la plupart des unités, les éléments suivants sont considérés comme le minimum pour un dépistage du sepsis :
- numération sanguine complète
- urée et électrolytes, avec estimation du glucose
- hémoculture
- radiologie thoracique
- ponction lombaire
- poche d'urine ou aspiration sus-pubienne de l'urine
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