Les troubles de la motilité gastrique, dus par exemple au diabète ou à la sclérose systémique, étaient traités auparavant par le cisapride à raison de 10 mg trois fois par jour ou une fois par jour. Un traitement de six semaines était recommandé.
Ce médicament a été retiré de la vente au Royaume-Uni le 28 juillet 2000 jusqu'à nouvel ordre. En effet, le cisapride peut allonger l'intervalle QT, ce qui peut entraîner des arythmies ventriculaires rares mais potentiellement mortelles. Le comité sur la sécurité des médicaments a conseillé d'arrêter tout traitement au cisapride et de changer les patients pour un traitement alternatif si nécessaire.
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