Les patients atteints de COAD sont déjà hypoxiques. Ainsi, en raison de la pente de la courbe de désaturation de l'oxyhémoglobine, toute baisse de la PaO2 entraîne une baisse importante de la saturation en oxygène. Une désaturation pouvant aller jusqu'à 50 % peut se produire.
Il existe une hypoventilation alvéolaire due à :
- les muscles accessoires volontaires sont inhibés pendant le sommeil paradoxal, ce qui entraîne une réduction du tonus des muscles accessoires de la respiration
- la respiration pendant le sommeil paradoxal est superficielle, ce qui réduit la ventilation alvéolaire en cas d'hypoventilation alvéolaire.
- la réduction du tonus musculaire entraîne une augmentation de la résistance des voies aériennes supérieures
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