La spondylarthrite ankylosante a tendance à être présente dans les familles dont les proches parents souffrent soit de spondylarthrite ankylosante, soit d'une des autres spondarthrites séronégatives telles que la maladie de Reiter, l'arthrite psoriasique ou l'arthrite entéropathique.
Toutes ces affections sont fortement associées à l'antigène majeur d'histocompatibilité HLA B27.
Il a été postulé qu'une infection génito-urinaire ou intestinale pouvait déclencher le développement de la maladie chez les individus génétiquement prédisposés. Les bactéries Klebsiella sont porteuses d'antigènes qui imitent l'antigène B27.
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