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Die Regulierung der hepatischen Glykogensynthase sollte unter dem Gesichtspunkt der Struktur und Funktion betrachtet werden:
Daher wird die Glykogensynthase durch Wirkstoffe stimuliert, die die cAMP-Konzentration senken, z. B. Insulin, und durch Wirkstoffe gehemmt, die den cAMP-Spiegel erhöhen, z. B. Glucagon, Adrenalin.
Ebenso reduziert ein erhöhter Anteil des Enzyms Glykogenphosphorylase in der aktiven a-Form, wie er bei einer reduzierten zellulären Glukosekonzentration auftritt, die Aktivität der Glykogensynthase.
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