Die klinischen Merkmale eines kongenitalen hypoplastischen Daumens sind je nach Schweregrad des Phänotyps sehr unterschiedlich. Bei der schwersten Form wird ein fehlender Daumen von Geburt an festgestellt. Im anderen Extremfall können sehr milde Formen der Daumenhypoplasie bis ins Erwachsenenalter unbemerkt bleiben. In diesem Spektrum sollten die folgenden Merkmale beachtet werden:
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