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Die dermo-epidermale Junktionszone ist lichtmikroskopisch durch eine unebene Grenzfläche gekennzeichnet. Feine bindegewebige dermale Papillen und gröbere bindegewebige dermale Grate ragen von der Dermis nach oben. Die regelmäßige Anordnung der letzteren bestimmt den "Fingerabdruck" eines Menschen. An Stellen mit mechanischer Belastung oder Scherkräften ragen entsprechende epidermale Grate nach unten.
Das Elektronenmikroskop zeigt, dass die Keratinozyten des Stratum basale auf einer hochstrukturierten Basalmembran sitzen. Die Membran besteht aus einer Lamina lucida, die oberflächlich von einer Lamina densa aus Typ-IV-Kollagen umgeben ist. Verschiedene Bindegewebsfasern überspannen die Scheide zur papillären Dermis. Antikörper gegen ein Element der Lamina lucida, das die basalen Keratinozyten und das Kollagen der Lamina densa verbindet, lösen ein bullöses Pemphigoid aus.
Die dermo-epidermale Grenzfläche ist der Bereich, der am deutlichsten mit der Entstehung von Juckreiz verbunden ist.
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