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Für eine hochselektive Vagotomie kann ein Schnitt in der Mittellinie verwendet werden, aber einige Quellen empfehlen einen Schnitt zwischen dem linken Rippenbogen und dem Schwertfortsatz bis unterhalb des rechten Rippenbogens.
Der Magen wird nach unten gezogen - die Nerven an der kleinen Kurve treten meist deutlich hervor. Etwas oberhalb des Eintrittspunktes des Nervus Latarjet in die Antrumregion wird eine Öffnung in den avaskulären Teil des Omentum lesser gemacht. Die Serosa wird entlang der kleinen Kurve nach oben geschnitten; die Magengefäße werden ligiert und auf dem Weg durchtrennt; die Vagalnerven werden ebenfalls durchtrennt. Der Schnitt wird bis zur Kardia fortgesetzt, die Speiseröhre wird mobilisiert und nach rechts gezogen, und schließlich werden die Nerven an der linken Basis der Speiseröhre bis zum Fundus isoliert und geteilt. Schließlich erfolgt die letzte feine Nervendurchtrennung an der Korpus/Antrum-Grenze; die Lokalisierung dieser Stelle kann durch eine intragastrische pH-Elektrode unterstützt werden.
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