Der Nervus pharyngeus entspringt auf beiden Seiten aus dem Ganglion inferior des Nervus vagus. Er umschlingt die Arteria carotis interna zwischen ihr und der Vena jugularis interna und verläuft posteromedial zum hinteren Teil des Pharynx. Hier verzweigt er sich und vereinigt sich mit dem Plexus pharyngeus auf der Höhe der mittleren Rachenabschnürung.
Von seinem anatomischen Ursprung her ist der Nervus pharyngeus ein Ast des Vagus. Er führt jedoch hauptsächlich Nervenfasern aus dem akzessorischen Teil des Hirnnervs, die ihren Ursprung im Nucleus ambiguus der Medulla haben. Es können auch einige sensorische Fasern zum sensorischen Kern des Nervus trigeminus verlaufen.
Über den Plexus pharyngeus versorgt der Nervus pharyngeus die meisten motorischen Fasern der folgenden Muskeln:
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