Die wichtigste unerwünschte Wirkung von Cholsäuren ist Durchfall infolge einer verminderten gastrointestinalen Wasser- und Elektrolytwiederaufnahme. Mit der Zeit entwickelt sich eine Toleranz, und bei Ursodesoxycholsäure ist diese Wirkung weniger wahrscheinlich.
Beide können peptische Ulzerationen verschlimmern.
Chenodeoxycholsäure kann die Leberfunktion beeinträchtigen.
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