La pancreatitis crónica debe diferenciarse del carcinoma pancreático, normalmente mediante ecografía o TC.
Otras pruebas potencialmente útiles para diferenciar estas afecciones son el examen citológico del líquido del conducto pancreático, la biopsia del páncreas con aguja fina y la medición de marcadores tumorales de carcinoma pancreático, como el antígeno carcinoembrionario y el CA19-9 (aunque no son patognomónicos de cáncer de páncreas).
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