Las parejas masculinas pueden estar colonizadas por Gardnerella vaginalis, y algunos organismos causantes de vaginosis también se han encontrado en el recto, lo que sugiere que éste puede constituir un reservorio para la infección vaginal.
El cambio inicial en la patogénesis es probablemente un aumento del pH vaginal de pH 4,0 a pH 5,5. Esto se debe probablemente a la producción de ácido fólico. Esto se debe probablemente a la producción de aminas por Gardnerella y Prevotella.
No está claro por qué sólo algunas mujeres son susceptibles.
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