La colitis pseudomembranosa se asocia a la administración de antibióticos de amplio espectro, lo que provoca la muerte de las bacterias normales del intestino y el crecimiento de Clostridium difficile.
Las cepas patógenas de C. difficile producen toxinas que provocan diarrea y colitis. Las cepas de C. difficile que no producen toxinas no son patógenas. Las dos toxinas producidas por C. difficile son la toxina A, una enterotoxina de 308 kd, y la toxina B, una citotoxina de 250-270 kd. Los mecanismos de acción intracelular de estas dos toxinas son poco conocidos; la toxina B es aproximadamente 1000 veces más potente que la toxina A.
Como resultado de la intensa inflamación, se forma una "pseudomembrana" gruesa y fibrinosa sobre la superficie del colon. Esta pseudomembrana alberga la proliferación de Clostridium difficile, lo que les permite seguir produciendo toxina.
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