- trisomías, en particular Down, también 18 y 13 (aunque una AFP baja no es tan precisa para predecir Down como una AFP alta para predecir espina bífida).
- una AFP baja puede observarse en madres que padecen diabetes, sin implicación de trisomía.
- sobreestimación de la gestación
- peso materno superior a la media
- aborto espontáneo
- algunos embarazos molares
- embarazo no viable
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