La aspirina provoca la modificación de la actividad ciclooxigenasa de la prostaglandina sintasa por acetilación permanente de la proteína.
Existen dos isoenzimas de la prostaglandina sintasa:
Los efectos beneficiosos de la aspirina, como la analgesia y la reducción de la adhesión plaquetaria, se deben al bloqueo de la producción de prostaglandinas. En este último caso, la aspirina inhibe la producción de tromboxano A2 protrombótico en las plaquetas y de prostaciclina antitrombótica en las paredes endoteliales. Sin embargo, el efecto sobre las plaquetas se produce a una concentración inferior de aspirina que sobre las células endoteliales; además, las células endoteliales pueden resintetizar los metabolitos del ácido araquidónico, mientras que las plaquetas no.
El efecto secundario no deseado de irritación gástrica se debe probablemente a la reducción de la producción de prostaciclina, un vasodilatador importante para mantener un buen riego sanguíneo en la mucosa gástrica.
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