El pronóstico depende de la etiología y la gravedad de la enfermedad:
- embarazo - 90% de mortalidad
- hepatitis viral - mortalidad del 60
- timoma - la extirpación del tumor puede dar lugar a una recuperación completa
- tuberculosis: el tratamiento satisfactorio de la infección se asocia a una recuperación hematológica completa
- anemia aplásica grave - menos del 50% de posibilidades de sobrevivir más de 6 meses
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