La vagotomía selectiva es un método quirúrgico para reducir la producción de ácido gástrico. Las fibras vagales que van hacia el estómago se dividen, mientras que las fibras que van hacia y desde las vísceras abdominales se conservan. Esta técnica está especialmente indicada cuando es necesario realizar un drenaje gástrico, por ejemplo en caso de estenosis pilórica, úlceras duodenales estenosantes o sangrantes.
La incidencia de complicaciones, como la diarrea grave, es menor que en la vagotomía troncular, pero la tasa de recidiva de la úlcera es mayor.
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