La localización mesangial de los complejos de IgA sugiere el atrapamiento de complejos o agregados inmunes circulantes. El 50% de los pacientes con enfermedad de Berger presentan niveles elevados de IgA.
La nefropatía se produce por la activación de la vía alterna del complemento.
Parece existir un defecto hereditario en el manejo de la IgA en estos pacientes.
Existe una asociación con HLA B35 y D4.
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