E. coli es responsable del 80% de los casos, la mayoría debidos a un subconjunto específico de E. coli (cepas uropatógenas). Estas cepas poseen determinantes específicos de virulencia que les permiten infectar el tracto urinario superior de individuos normales y sanos.
- Las E.coli uropatógenas pertenecen a un pequeño número de grupos de serotipos O:K:H. Suelen producir tanto hemolisina como aerobactina. También suelen tener pili específicos asociados a la pielonefritis que median la adhesión a las células uroepiteliales.
- Otros organismos suelen estar asociados a anomalías estructurales, como proteus, staphylococcus, streptococcus, klebsiella, pseudomonas.
- la tuberculosis suele causar una piruria "estéril".
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