Les lignes directrices suivantes peuvent aider au diagnostic différentiel de la diarrhée :
- une diarrhée aqueuse abondante suggère une étiologie organique
- la diarrhée nocturne suggère une étiologie organique - le patient se réveille la nuit et a besoin d'ouvrir les intestins
- l'évacuation fréquente de petites quantités de matières fécales suggère une maladie fonctionnelle de l'intestin, par exemple le syndrome de l'intestin irritable
- une diarrhée sanglante implique une maladie du côlon, souvent une maladie inflammatoire de l'intestin ou un carcinome, ou une diarrhée infectieuse invasive, par exemple Campylobacter jejuni.
- la diarrhée aiguë a souvent une étiologie infectieuse
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