Les causes de l'occlusion gastro-intestinale néonatale sont les suivantes
- atrésie d'une partie quelconque du tractus gastro-intestinal
- blocage, par exemple avec du méconium
- absence de péristaltisme normal, par exemple dans le cas de la maladie de Hirschsprung
- des sténoses, par exemple à la suite d'une entérocolite nécrosante - bien que cela soit probablement plus tardif
- une invagination peut parfois se produire chez le nouveau-né.
Plus tard dans la période néonatale, d'autres pathologies doivent être envisagées, notamment la sténose du pylore.
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