Le tiers moyen de la face se développe à la suite de la migration et de la fusion de plis mésodermiques recouverts d'ectoderme. La fente labiale unilatérale, bilatérale ou, rarement, médiane, résulte de l'échec de la fusion du palais primaire.
Le palais secondaire se développe à partir des plis situés de part et d'autre de la langue. Ces plis s'élèvent au-dessus de la langue et fusionnent sur la ligne médiane pour former le vrai palais. Une fente palatine se produit lorsque la migration des tissus est désorganisée ou obstruée par la langue. Dans de rares cas, une fente palatine est causée par une petite mandibule.
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