Les fentes labiales et palatines sont relativement fréquentes, puisqu'elles surviennent environ une fois sur 600 naissances vivantes. La majorité de ces anomalies sont des cas isolés, mais il peut y avoir des antécédents familiaux positifs. Certains cas ont été liés à la corticothérapie maternelle.
La répartition des différents types de fentes labiales et/ou palatines est approximativement la suivante :
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