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Le traitement de base est l'amphotéracine B par voie intraveineuse :
Les effets indésirables sont fréquents, en particulier l'urée sanguine doit être surveillée ; si l'urée s'élève de manière significative, l'amphotéracine doit être arrêtée jusqu'à ce que la fonction rénale s'améliore.
L'ajout de flucytosine (150 mg/kg) améliore les résultats, en particulier chez les patients atteints du SIDA.
Le traitement doit durer 6 semaines.
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