Le diagnostic définitif repose sur le tableau clinique et sur des cultures de selles positives pour Salmonella. Celles-ci peuvent rester positives jusqu'à 8 semaines dans 30 % des cas.
Une aide épidémiologique est nécessaire pour identifier la source.
Une coproculture positive à la salmonelle n'exclut pas la possibilité d'une maladie inflammatoire de l'intestin coïncidant avec une salmonellose.
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