Zoonoses transmises par les chauves-souris : transmission, impact, prévention et prise en charge

Facteurs environnementaux mondiaux : le changement climatique d’origine anthropique, la déforestation et la perte de biodiversité modifient les habitats et les habitudes alimentaires des chauves-souris, poussant les espèces frugivores et insectivores à s’introduire dans les zones urbaines et agricoles, ce qui accroît les risques de transmission zoonotique (1) :

• biologie exceptionnelle de l’hôte : les chauves-souris constituent des réservoirs viraux idéaux car elles inhibent les réponses immunitaires pro-inflammatoires — ce qui leur permet de rester asymptomatiques tout en présentant des infections à titre élevé — et vivent en colonies très sociales qui facilitent la transmission rapide des agents pathogènes au sein de l’espèce
• principaux agents pathogènes cliniques : parmi les agents pathogènes associés aux chauves-souris et présentant un intérêt majeur pour la santé publique, on trouve les lyssavirus (virus de la rage, lyssavirus des chauves-souris d’Australie), les filovirus (virus Ebola, virus de Marburg), les hénipavirus (virus Nipah, virus Hendra) et les champignons dimorphiques (Histoplasma capsulatum)

Caractéristiques cliniques spécifiques aux agents pathogènes et voies de transmission

1. Filovirus (virus Ebola et virus de Marburg)

• Maladie à virus Ebola (MVE):
  • Transmission : chauves-souris frugivores (par ex. Hypsignathus monstrosus) et les chauves-souris insectivores sont fortement soupçonnés d’être des réservoirs potentiels (ce qui est corroboré par la détection de l’ARN par PCR, la séropositivité et les liens épidémiologiques avec la manipulation des chauves-souris et la consommation de viande de brousse), bien que l’isolement direct d’un virus vivant infectieux chez des chauves-souris frugivores sauvages n’ait pas encore été prouvé ; la propagation secondaire est due aux contacts interhumains par le biais de liquides biologiques infectieux (sang, sueur, vomissures, urine, selles, lait maternel et sperme)
  • persistance virale : le virus viable persiste dans des sites immunoprivilégiés (par exemple, le sperme pendant plus de 470 jours après la guérison, ce qui entraîne une transmission sexuelle, ainsi que dans le lait maternel)
  • tableau clinique : période d’incubation de 2 à 21 jours (moyenne de 6,2 jours) ; forte fièvre, myalgie sévère et fatigue, évoluant vers des symptômes gastro-intestinaux abondants, un choc, une coagulopathie/hémorragie et une défaillance multiviscérale
  • mortalité : le risque global de létalité varie de 53 % à 75 % selon les espèces (il est le plus élevé pour l’ébolavirus du Zaïre)
• Maladie à virus de Marburg (MVD) :
  • Transmission : transmission primaire par spillover à partir de chauves-souris frugivores égyptiennes vivant dans des grottes (Rousettus aegyptiacus) ; la propagation secondaire se fait par contact direct avec des fluides corporels infectieux
  • tableau clinique : période d'incubation de 3 à 13 jours ; apparition soudaine d'une forte fièvre, de maux de tête sévères, d'une diarrhée aqueuse, de crampes abdominales et de manifestations hémorragiques graves
  • mortalité : risque global de létalité estimé à 61 %

1. Lyssavirus (virus de la rage et lyssavirus des chauves-souris australiennes)

• virus de la rage :
  • Transmission : par la salive, lors de morsures, de griffures ou par contact avec les muqueuses ; chauves-souris vampires (Desmodus rotundus) sont à l’origine de la transmission sylvatique dans les Amériques, tandis que les chiens restent le principal vecteur à l’échelle mondiale (> 95 % des décès humains)
  • tableau clinique : la période d'incubation varie de quelques jours à plus d'un an ; la maladie évolue de paresthésies non spécifiques et de fièvre vers la rage furieuse (hyperactivité, agitation, hydrophobie, aérophobie) ou la rage paralytique (tétraplégie, paralysie bulbaire)
  • Mortalité : le risque de létalité avoisine les 100 % dès l’apparition des symptômes cliniques
• Lyssavirus des chauves-souris australiennes (ABLV) :
  • Transmission : se transmet par des griffures ou des morsures de chauves-souris frugivores (renards volants) ou insectivores infectées en Australie
  • tableau clinique : la période d'incubation varie de 3 semaines à 27 mois ; se manifeste par de la fièvre, des maux de tête et de la fatigue, évoluant rapidement vers une encéphalite grave, des spasmes musculaires, une paralysie et la mort
  • mortalité : risque de létalité de 100 % (4 cas humains enregistrés au total)

1. Hénipavirus (virus Nipah et virus Hendra)

• Virus Nipah (NiV) :
  • Transmission : contact direct avec des roussettes (Pteropus spp.), ingestion de sève de palmier à dattes crue contaminée par la salive ou les excréments de chauves-souris (Asie du Sud), contact avec des hôtes animaux intermédiaires (par exemple, des porcs en Malaisie, des chevaux aux Philippines) ou contact interhumain
  • tableau clinique : période d’incubation de 8 à 17 jours ; syndrome initial de type grippal évoluant rapidement vers une encéphalite aiguë (confusion, convulsions, neuropathies crâniennes) et une détresse respiratoire sévère
  • mortalité et séquelles : le risque global de létalité varie de 28,9 % (Malaisie) à 82,7 % (Inde) ; 24 % à 45 % des survivants souffrent de séquelles neurologiques ou neuropsychiatriques à long terme (déficience cognitive, fatigue chronique, encéphalite récidivante)
• Virus Hendra (HeV) :
  • transmission : transmission interespèces à partir de Pteropus aux chevaux via des pâturages ou des aliments contaminés par l’urine ou les excréments ; transmission à l’homme exclusivement par contact physique étroit avec les fluides corporels de chevaux infectés
  • tableau clinique : période d'incubation de 5 à 21 jours ; symptômes de type grippal évoluant vers une pneumonie grave et/ou une encéphalite
  • mortalité : risque de létalité de 57 % (4 décès sur 7 cas humains)

1. Champignons dimorphiques (Histoplasma capsulatum)

• histoplasmose :
  • transmission : inhalation de microconidies en suspension dans l’air provenant de sols ou de matières organiques fortement enrichis en guano de chauves-souris (par exemple, grottes, greniers, arbres creux)
  • Tableau clinique : période d'incubation de 14 à 28 jours ; maladie pulmonaire aiguë (fièvre, toux sèche, douleur thoracique sous-sternale), maladie pulmonaire cavitaire chronique ou histoplasmose disséminée progressive touchant plusieurs systèmes organiques
  • mortalité et groupes à risque : faible mortalité chez les individus immunocompétents (~5 %) ; risque élevé de létalité (20,8 % à 52,8 %) chez les individus atteints d’un VIH/SIDA avancé ou d’une immunosuppression sévère

Stratégies de prévention et de prise en charge

Vaccination et prophylaxie post-exposition (PEP)

• PEP contre la rage et l’ABLV :
  • Catégorie I (contact/léchage de la peau intacte) : laver la peau exposée
  • Catégorie II (égratignures mineures/morsures sans saignement) : lavage immédiat de la plaie + série de vaccins antirabiques (intradermiques ou intramusculaires)
  • Catégorie III (morsures/égratignures transdermiques, exposition à une chauve-souris, salive sur les muqueuses) : lavage immédiat et minutieux de la plaie + série de vaccins antirabiques + immunoglobulines antirabiques (RIG) injectées dans ou autour de la plaie (les RIG ne sont pas nécessaires en cas de vaccination antérieure)
  • Efficacité du vaccin : les voies intradermique (0,1 ml) et intramusculaire (0,5/1,0 ml) présentent des taux de séroconversion équivalents (≥ 0,5 UI/ml au 14e jour)
• Vaccination contre Ebola :
  • rVSV-AG-ZEBOV (Ervebo) : vaccin recombinant vivant à dose unique, approuvé par la FDA et l’EMA, offrant une protection solide contre le virus Ebola Zaïre chez les adultes et les enfants

Pharmacothérapie ciblée

• Virus Ebola du Zaïre : les anticorps monoclonaux Inmazeb (REGN-EB3) et Ebanga (MAb114), approuvés par la FDA, réduisent significativement la mortalité à 28 jours par rapport aux soins standard ou aux anciens schémas thérapeutiques
• Histoplasmose : l’amphotéricine B liposomale est supérieure à l’amphotéricine B désoxycholate pour le traitement d’induction dans les formes graves ou disséminées ; l’itraconazole oral est le médicament de choix pour la consolidation et la suppression à long terme
• Soins de soutien : pilier du traitement contre les virus Marburg, Nipah, Hendra, la rage et l’ABLV (par exemple, prise en charge intensive de l’hydratation et de l’équilibre électrolytique, contrôle des crises, prise en charge en soins intensifs)

Approche « One Health » et prévention écologique

• Protection par barrière : exclusion physique des chauves-souris des espaces de vie, recouvrement des récipients de collecte de sève de palmier dattier avec des jupes en bambou et prévention de l’exposition aux grottes et au guano
• santé animale : vaccination systématique des chiens domestiques contre la rage et des chevaux contre le virus Hendra ; maintien des mangeoires et abreuvoirs couverts et éloignés des gîtes de chauves-souris
• sécurité sanitaire : mesures strictes de protection par barrière, isolement en pression négative et équipement de protection individuelle (EPI) dédié lors des soins aux patients

Référence :

1. Stanhope J, Boardman WSJ, Burrell C, Bi P, Weinstein P. Zoonoses transmises par les chauves-souris : transmission, impact, prévention et prise en charge. BMJ. 2026 ; 395 : e100560. DOI : 10.1136/bmj-2026-100560.