Le risque d'anomalie congénitale est de 30 % en fonction de l'âge maternel et de l'AFP.
Dans un protocole moyen, le résultat est considéré comme élevé si le niveau, représenté par un multiple de la médiane, est 2,4 fois supérieur à la normale, c'est-à-dire si le risque d'anomalie est de 1 sur 200 ou plus.
Si la concentration d'AFP est élevée dans le sérum maternel, le profil des enzymes cholinestérases sur l'électrophorèse sur gel de polyacrylamide est souvent utile. Les anomalies ouvertes du tube neural et la moitié des anomalies de la paroi abdominale antérieure présentent une deuxième bande.
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