Il s'agit notamment de
- hémorragie, inversée par le sulfate de protamine
- thrombocytopénie - elle est due à un effet direct de l'héparine sur les plaquettes, qui s'améliore généralement avec l'arrêt de l'héparine. Il semble également exister un mécanisme immunitaire qui se produit 6 à 12 jours après le début du traitement à l'héparine. Cette dernière cause de thrombocytopénie par agrégation des plaquettes à médiation immunitaire associée à l'héparine peut prédisposer à la formation d'un thrombus plaquettaire et d'une coagulation intravasculaire disséminée, en plus de la thrombocytopénie.
- Les autres effets secondaires comprennent l'alopécie et l'ostéoporose.
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