La présence de bactéries à l'examen microscopique de l'urine constitue une preuve immédiate de l'infection des voies urinaires. La coloration de Gram peut aider à identifier l'agent pathogène.
Si la bactériurie s'accompagne d'une pyurie, l'infection des voies urinaires est plus probable. Cependant, un échantillon à mi-parcours doit également être envoyé pour une culture quantitative et des sensibilités avant d'entamer le traitement.
Un échantillon d'urine mal prélevé peut très bien contenir des organismes urétraux et périnéaux.
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