Les complications du traitement chirurgical de la clinodactylie sont d'autant plus fréquentes que la déformation initiale est importante. Toute intervention osseuse peut être associée à des adhérences aux tendons environnants. Les interventions qui raccourcissent considérablement le doigt peuvent produire un décalage de l'extenseur, car l'appareil extenseur extrinsèque ne parvient pas à prendre le relais de la distance réduite qui le sépare de son insertion. Les lésions de la partie horizontale de l'épiphyse lors d'une procédure d'épiphyséolyse peuvent entraîner un arrêt de la croissance ou une déviation anormale supplémentaire avec le temps. Les ostéotomies de coin sont difficiles à réaliser et un doigt peut ne pas être parfaitement aligné le long de son grand axe après l'opération.
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