La vagotomie tronculaire consiste à diviser les troncs vagaux antérieur et postérieur à proximité de l'œsophage abdominal et juste en dessous du diaphragme. Cette opération est très efficace pour réduire la sécrétion d'acide et favorise donc la cicatrisation des ulcères.
Cependant, la perméabilité du sphincter pylorique dépend du tonus vagal et, par conséquent, la dénervation seule peut entraîner une obstruction fonctionnelle de la voie d'écoulement. Par conséquent, une procédure de drainage est employée en même temps que la vagotomie tronculaire pour encourager la vidange, par exemple une pyloroplastie ou une gastro-jéjunostomie.
Malgré des complications telles que la diarrhée, la vagotomie tronculaire reste une opération populaire pour les ulcérations chroniques en raison de sa simplicité. Elle est particulièrement indiquée dans les situations suivantes
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