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L'échec de la canalisation du sinus urogénital peut produire un hymen imperforé ou, plus rarement, une atrésie vaginale.
L'échec de la recanalisation des canaux mullériens peut entraîner une atrésie de la partie supérieure du vagin ou du col de l'utérus.
L'échec de la fusion des canaux mullériens entraîne une réduplication de l'utérus, du col de l'utérus ou du vagin.
L'absence de développement des deux canaux mullériens se traduit par l'absence totale d'utérus et d'oviductes et par une aménorrhée.
La persistance des restes du canal de Wolff peut produire des kystes de l'hydatide de Morgagni dans le mésovarium, des kystes entre les feuillets des ligaments larges ou des kystes du canal de Gartner.
Les anomalies des organes génitaux externes comprennent des lèvres fusionnées et des lèvres de différentes tailles.
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