Le réflexe d'accommodation a son entrée afférente dans la voie visuelle primaire, c'est-à-dire séquentiellement : rétine - nerf optique - chiasme optique - tractus optique - corps géniculé latéral - radiation optique - cortex visuel, aire 17.
La voie efférente du réflexe commence dans le cortex visuel, aire 19. De là, les fibres corticocolliques se dirigent vers les colliculi supérieurs et les fibres corticopretectales vers les noyaux prétectaux. À partir des colliculi supérieurs, des liaisons interneuronales avec le noyau oculomoteur du mésencéphale permettent la contraction du recti médian et donc la convergence. À partir des noyaux prétectaux, les fibres se dirigent vers le noyau parasympathique d'Edinger Westphal, puis vers la cavité orbitaire dans le nerf oculomoteur, où elles font synapse avec le ganglion ciliaire. À partir du ganglion ciliaire, les fibres postganglionnaires innervent le muscle ciliaire pour élargir le cristallin et la pupille constrictrice pour comprimer l'iris.
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