Test urinaire GALEAS et biomarqueurs de méthylation pour le cancer de la vessie

GALEAS est un test non invasif de biomarqueurs urinaires utilisant le séquençage de nouvelle génération (NGS) ultra-profond ciblé pour détecter des mutations génétiques somatiques dans un panel de 23 gènes liés au cancer urothélial de la vessie (CV) (1) :

• vise à servir d’outil de triage moléculaire dans les protocoles d’évaluation de l’hématurie urgente et dans la surveillance post-résection du cancer de la vessie non invasif sur le plan musculaire (NMIBC), afin de réduire en toute sécurité le recours à la cystoscopie flexible invasive
• utilise des identifiants moléculaires uniques (UMI) pour éliminer les faux positifs dus à des artefacts de séquençage ou à l’hématopoïèse clonale, permettant ainsi une détection fiable des variants nucléotidiques simples (SNV) à faible fréquence

Principaux résultats cliniques

Performances diagnostiques de GALEAS Bladder Alone

• Précision globale élevée : atteint une sensibilité d’environ 92 % et une spécificité comprise entre environ 89 % et 92 % dans l’évaluation clinique de l’hématurie
• Détection des tumeurs de haut grade : détecte plus de 96 % à 97 % des cancers de la vessie de haut grade et invasifs au niveau musculaire, ce qui confère une valeur prédictive négative élevée (VPN > 99 %) pour exclure une maladie agressive
• large couverture tissulaire : le panel ciblé analyse les mutations somatiques présentes dans environ 96 % de toutes les tumeurs urothéliales primaires de la vessie

Intérêt de l’ajout de marqueurs de méthylation au panel (2)

• Hypothèse testée : les chercheurs ont cherché à déterminer si l’ajout d’un panel épigénétique (23 loci d’ADN hyperméthylés) permettrait de détecter les cas de faux négatifs non identifiés par le test de mutation
• Résultats de l’étude : l’ajout de marqueurs de méthylation n’a apporté aucun bénéfice diagnostique clinique supplémentaire, la sensibilité globale combinée restant inchangée à environ 93 %
• forte concordance : les marqueurs de mutation et de méthylation présentaient une forte concordance (environ 85 %), et tous les échantillons d’urine de la tumeur vésicale GALEAS se révélant faussement négatifs étaient également totalement négatifs pour les marqueurs de méthylation

Point clé pour la pratique clinique

• Cause des faux négatifs :
  • les résultats de faux-négatifs de l’ADN urinaire ne sont pas dus à l’absence de cibles de mutation ; ils surviennent plutôt lorsque des tumeurs de bas grade ou de petite taille libèrent trop peu de cellules malignes dans l’urine (faible fraction cellulaire tumorale)
• limite diagnostique :
  • comme les mutations de l’ADN et les marqueurs de méthylation disparaissent en l’absence de cellules tumorales libérées, l’ajout de marqueurs épigénétiques supplémentaires ne permet pas de surmonter la limite physique liée à une faible libération cellulaire

Références

1. Ward DG, Baxter L, Ott S, Gordon NS, Wang J, Patel P, Piechocki K, Silcock L, Sale C, Zeegers MP, Cheng KK, James ND, Bryan RT. Détection hautement sensible et spécifique du cancer de la vessie par séquençage ultra-profond ciblé de l’ADN urinaire. European Urology Oncology. 2023 ; 6(1) : 67-75.
2. Gordon NS, McGuigan EK, Ondasova M, Knight J, Baxter LA, Ott S, Hastings RK, Zeegers MP, James ND, Cheng KK, Goel A, Yu M, Arnold R, Bryan RT, Ward DG. Comparaison et association de tests urinaires basés sur les mutations et la méthylation pour la détection du cancer de la vessie. Biomarker Research. 2024 ; 12(1) : 133.