Le jéjunum normal contient 10 à 1000 organismes par ml. Un nombre total d'organismes aérobies et anaérobies supérieur à 100 000 permet de diagnostiquer une prolifération bactérienne.
La charge bactérienne de l'estomac et de l'intestin grêle est maintenue à un faible niveau en raison des facteurs suivants
- de l'acide gastrique
- d'une motilité intestinale élevée
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