Un pH anormalement bas, c'est-à-dire inférieur à 7,0, peut indiquer une éjaculation rétrograde lorsqu'il est associé à un volume d'éjaculat très faible. Un pH inférieur à 7,0, un volume normal et une azoospermie peuvent indiquer une obstruction des canaux éjaculatoires ou une absence bilatérale congénitale des canaux.
Un pH anormalement élevé, c'est-à-dire supérieur à 8,5, peut indiquer une infection ou un dysfonctionnement de l'une des glandes annexes.
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