GALEAS-urinetest en methylatiebiomarkers voor blaaskanker

GALEAS is een niet-invasieve urinebiomarkertest die gebruikmaakt van gerichte, ultradiepe next-generation sequencing (NGS) om somatische genmutaties te detecteren in een panel van 23 genen die verband houden met urotheelblaaskanker (BC) (1):

• is bedoeld als moleculair triage-instrument in spoedeisende beoordelingstrajecten voor hematurie en bij de follow-up van niet-spierinvasieve blaaskanker (NMIBC) na resectie, om de afhankelijkheid van invasieve flexibele cystoscopie op veilige wijze te verminderen
• maakt gebruik van unieke moleculaire identificatiecodes (UMI’s) om vals-positieve resultaten als gevolg van sequentieartefacten of klonale hematopoëse uit te sluiten, waardoor betrouwbare detectie van laagfrequente enkelvoudige nucleotidevarianten (SNV’s) mogelijk wordt

Belangrijkste klinische bevindingen

Diagnostische prestaties van GALEAS Bladder Alone

• hoge algehele nauwkeurigheid: bereikt een sensitiviteit van ~92% en een specificiteit van ~89% tot 92% bij de klinische evaluatie van hematurie
• detectie van hooggradige ziekte: detecteert meer dan 96% tot 97% van de hooggradige en spierinvasieve blaaskankers, wat een hoge negatieve voorspellende waarde (NPV >99%) oplevert om agressieve ziekte uit te sluiten
• brede weefseldekking: het gerichte panel onderzoekt somatische mutaties die aanwezig zijn in ~96% van alle primaire urotheelkankers van de blaas

De meerwaarde van het toevoegen van methyleringsmarkers aan het panel (2)

• geteste hypothese: onderzoekers onderzochten of het toevoegen van een epigenetisch panel (23 hypergemethyleerde DNA-loci) vals-negatieve gevallen kon opsporen die door de mutatietest werden gemist
• uitkomst van het onderzoek: het toevoegen van methylatie-markers leverde geen extra klinisch diagnostisch voordeel op; de gecombineerde totale sensitiviteit bleef onveranderd op ~93%
• hoge concordantie: mutatie- en methylatie-markers vertoonden een hoge mate van overeenstemming (~85%), en alle vals-negatieve GALEAS-blaasurine monsters waren ook volledig negatief voor methylatie-markers

Belangrijkste conclusie voor de klinische praktijk

• Oorzaak van vals-negatieve resultaten:
  • vals-negatieve DNA-resultaten in urine worden niet veroorzaakt door ontbrekende mutatiedoelen; ze treden juist op wanneer laaggradige of kleine tumoren te weinig kwaadaardige cellen in de urine afgeven (lage tumorcelfractie)
• diagnostische bovengrens:
  • aangezien zowel DNA-mutaties als methyleringsmarkers verdwijnen wanneer er geen afgestoten tumorcellen aanwezig zijn, kan het toevoegen van extra epigenetische markers de fysieke beperking van een lage celafstoting niet overwinnen

Referenties

1. Ward DG, Baxter L, Ott S, Gordon NS, Wang J, Patel P, Piechocki K, Silcock L, Sale C, Zeegers MP, Cheng KK, James ND, Bryan RT. Zeer gevoelige en specifieke detectie van blaaskanker via gerichte ultradiepe sequentiebepaling van urine-DNA. European Urology Oncology. 2023;6(1):67-75.
2. Gordon NS, McGuigan EK, Ondasova M, Knight J, Baxter LA, Ott S, Hastings RK, Zeegers MP, James ND, Cheng KK, Goel A, Yu M, Arnold R, Bryan RT, Ward DG. Vergelijking en combinatie van op mutaties en methylatie gebaseerde urinetests voor de detectie van blaaskanker. Biomarker Research. 2024;12(1):133.