O tratamento inicial dos cálculos biliares na árvore biliar pode envolver a estabilização do doente se houver infeção. Isto implica fluidos intravenosos, analgesia e antibióticos.
A melhor forma de remover um cálculo é através de CPRE, esfincterotomia e extração com cesto de Dormia ou balão. A CPRE só é bem sucedida em cerca de 90% dos doentes. Os cálculos de grandes dimensões são difíceis de remover. Estes doentes necessitam de uma exploração cirúrgica dos canais biliares, da remoção dos cálculos e do encerramento do canal sobre um tubo em T. Normalmente, o tubo em T é removido. Normalmente, o tubo em T é removido dez dias mais tarde, após um colangiograma com tubo em T.
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