Os organismos infecciosos são capazes de causar diarreia de várias formas:
- danos na mucosa causados por ataque direto
- produção de toxinas após a ingestão
- produção de toxinas antes da ingestão
A diarreia propriamente dita pode ser
- secretora, em que a alteração do transporte membranar resulta numa diminuição da absorção de electrólitos e, consequentemente, da absorção de água
- diminuição da absorção, ela própria resultante de lesões da mucosa, osmose ou aumento da motilidade intestinal
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