O basófilo tem um núcleo lobulado com heterocromatina periférica e eucromatina central. Existem poucos organelos citoplasmáticos, exceto os grânulos caraterísticos, grandes e grosseiros, ligados à membrana. Os grânulos contêm uma variedade de enzimas:
- heparina
- histamina
- enzimas hidrolíticas
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