O diagnóstico da lepra é essencialmente clínico. O achado de bacilos ácido-rápidos em esfregaços da pele ou da mucosa nasal é altamente sugestivo da doença.
O diagnóstico definitivo é estabelecido pela cultura dos organismos nas patas de ratos ou tatus. Este processo é moroso e dispendioso. A reação em cadeia da polimerase pode proporcionar um rastreio rápido e sensível do Mycobacterium leprae, mas não está amplamente disponível.
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