O tratamento ótimo do AVC cardioembólico agudo representa um equilíbrio entre a redução da recorrência precoce da embolia e a precipitação de uma hemorragia cerebral secundária. Cerca de 12% dos doentes com um AVC cardioembólico agudo têm uma recorrência no prazo de 2 semanas; este número aumenta para cerca de 20% se houver fibrilhação auricular associada.
A heparina intravenosa deve ser administrada 48 horas após o evento. Este atraso é aconselhado devido à propensão dos acidentes vasculares cerebrais cardioembólicos para sofrerem uma transformação hemorrágica secundária. A anticoagulação deve ser adiada até 7-10 dias após o evento se houver défices neurológicos graves.
Os antibióticos, por si só, estão associados a uma redução da recorrência quando a suspeita é de endocardite infecciosa.
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