O tronco braquiocefálico origina-se da parte mais distal do truncus arteriosus durante o desenvolvimento. Esta zona, o saco aórtico, está em continuidade com a aorta ventral e a via de saída da aorta. À medida que a primeira se alonga, o saco aórtico divide-se em dois vasos, um dos quais é o tronco braquiocefálico. Este é proximal aos derivados do terceiro arco direito.
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