O diagnóstico de morte do tronco cerebral é feito quando o sistema reticular ativador ascendente (ARAS) é irreversivelmente danificado de tal forma que a consciência pode nunca ser atingida.
Deve ser claramente demonstrado que, na ausência de caraterísticas que possam mascarar os sinais clínicos, o ARAS não está a funcionar e não voltará a funcionar. Este estado pode ser inferido a partir do estado funcional dos núcleos do tronco cerebral dos nervos cranianos que estão em íntima associação anatómica com o ARAS.
A presença de uma lesão anatómica e, em certa medida, a sua irreversibilidade, são determinadas por TAC ou RMN.
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