O tratamento baseia-se na gravidade da asfixia. É necessária uma reanimação completa e o desmame só deve ser efectuado quando os gases sanguíneos estiverem normais.
A ventilação deve ser considerada conforme adequado - ou seja, na encefalopatia hipóxico-isquémica mais grave, quando existe uma doença pulmonar mais grave, apneia ou gases sanguíneos deficientes.
A acidose deve ser corrigida com ventilação ou com reposição de volume, conforme indicado.
As convulsões podem ser tratadas com fenobarbitona, utilizando medicamentos de segunda linha se as convulsões não forem controladas.
A coagulação deve ser medida e as anomalias devem ser corrigidas com plasma fresco congelado ou plaquetas.
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