A mortalidade global é de 50 a 60%, consoante o centro.
Os centros de referência terciários referem uma sobrevivência de cerca de 50% para as hérnias diafragmáticas suficientemente grandes para serem detectadas na ecografia anómala das 18 semanas de gestação.
Um bom indicador de prognóstico é a posição do estômago; se permanecer no abdómen, o prognóstico é bom; se estiver no tórax, o prognóstico é mau.
A morte é secundária a hipoplasia pulmonar.
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