Na perfuração do esófago que causa mediastinite aguda, os organismos envolvidos são frequentemente os que se encontram normalmente na flora oral, especialmente os anaeróbios.
A mediastinite aguda secundária à cirurgia envolve frequentemente organismos resistentes aos antibióticos utilizados na profilaxia perioperatória. Estes incluem Staph. aureus e bacilos gram-negativos, incluindo Pseudomonas aeruginosa.
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